政協咸寧市第五屆委員會下設辦公室、研究室、委員工作委員會和提案委員會、經濟人口資源環境委員會、教科衛體委員會、社會和法制委員會、港澳臺僑和民族宗教委員會、文化文史和學習委員會、農業和農村委員會等七個專門委員會。